SamantaStar, текстуры могут не пойти с новой версией. Если они шли на 1.1.0.35, не факт, что пойдут на 1.7.03.
Сэйвы хранятся в папке Мои документы(таки это твои документы

, в семерке не помню, что за аналог, по моему Users/{Имя_пользователя}/Документы)/My Games/Fallout 3/Saves и при сносе игры сохраняются. Но можешь для пущей вероятности скопировать их куда-нибудь.
Еще вопрос, так если в FOMM все моды отключить, Фолл все равно не запускается?