Да тут уже как хочешь. Отключить до боя за очиститель - это просто мой совет, чтобы небыло всяких несостыковок вроде той с радио.
Я так делал: проходил сюжетку до момента, когда отец ГГ с учёными шел работать над установкой и бросал их там, а сам шел немного прокачиваться в Пустошь, да Вашингтон изучать. Затем возвращался уровне не 15-м к учёным и до конца без перерывов проходил сюжетку. В самом конце, уже ворвавшись в очиститель с Сарой и Фоксом, перед дверями зала управления сохранялся и подключал Брокен Стил.
После концовки и добития Анклава шел углублённо исследовать Пустошь, проходить квесты и аддоны.
