Возможно кому-то пригодится. Нашел нечестный способ принудительно, через консоль, убрать у напарника его "встроенные" оружие и броню:
1) Открываем тильдой (`) консоль.
2) Кликаем курсором по напарнику, чтобы над ним отобразилось его имя и ID.
3) Пишем в консоли: removeitem [id вещи] [количество] (в количестве пишем 1, т.к. вещь у напарника, естественно, одна

)
4) Готово. Закрываем консоль.
ID "личных" вещей (то что мне удалось найти):
Вероника:
Капюшон Вероники (0016A26F)
Бронированная ряса Вероники (0014823Е)
Рауль:
Броня Рауля (0014В053)
Головной убор Рауля (0014В054)
Бронекомбинезон Рауля (0015EA6D)
Комбинезон Рауля "Петрошико" (000FD561)
Бун:
Берет Буна (000B7F53)
Охотничья винтовка Буна (с прицелом) (000СЕ549)
Аркейд:
Лабораторный халат Аркейда Геннона (0010CDA4)
Кэсс:
Шляпа Кэсс (0015EF8B)
Одежда Кэсс (001350EF)
Лили:
Перчатка Лили (00105CF6)
Лопасть винтокрыла Лили (00105CF5)
Вобще, чтобы посмотреть, что таскает с собой нпс, достаточно в режиме консоли ткнуть на него мышкой и набрать inv.
По такой же схеме, с помощью команды equipitem можно насильно заставить напарника одеть оружие и броню, которые он считает хуже своей (исключение: вещи несовместимые с его "моральными принципами", одежда легионеров для Буна, к примеру). Он их просто выбросит. Обмундирование должно быть в инвентаре у спутника.
Командой additem [ID вещи] можно вернуть напарнику его цацки. Схема та же: консоль, клик на напарнике, команда.
И способ немедленно призвать напарника из любой точки мира к себе:
1) Открываем тильдой (`) консоль.
2) Пишем в консоли:
prid [ID напарника]
disable
enable
moveto player
3) Готово. Закрываем консоль. Осматриваемся - напарник должен быть уже где-то рядом.
ID напарников:
Бун 00096BCE
Кэсс 00135F19
Вероника 000E32A9
Рауль 000E6105
Лили 0013D830
Аркейд 0010D8EB
ED-E 001732D1
Рэкс 0010D8DF